除了FCIP之外，另一个方法是iSCSI，这个方法是把用户的请求转换成SCSI代码，并将数据封装进IP包内在以太网内进行传输。为了连接地理位置分散的SAN，FCIP协议只能用于光纤通道技术的连接；相较而言， iSCSI可在现有以太网上运行。SAN连接， 诸如通过FCIP和iSCSI协议，可以在传统的数据存储系统的点对点连接的基础上，提供更高性能、有效性和容错性等优点。许多的厂商，包括思科、北电网络和朗讯已经引入基于FCIP的产品（诸如交换机和路由器）。一种被称为因特网光纤通道协议（iFCP）的混合技术，是FCIP协议的变体，用于移动在IP网络上，使用iSCSI协议传输的光纤通道数据。
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