浪潮助力南方医科大生物信息科研高效计算平台

"07年第四季度，我们实验室的整体工作效率提高了30%以上，物信息科研任务已取得阶段性成果，感谢所有同事的辛勤工作，也感谢校方给予我们的鼎力支持。"在南方医科大学基础医学院肿瘤研究所下属的医学信息检测技术重点实验室年底工作总结会议上，实验室负责人慷慨陈词，说出了每个科研人员的心声。

南方医科大学医学信息检测技术重点实验室长期致力于生物信息技术的分析和科研工作，承担过多项国家、学校的学术研究，曾经成功发现SARS病毒致命的主要物质成分，为治疗SARS药物的问世提供了可能。

在承担大量的信息数据处理工作的过程中，院系师生发现，整个IT系统的运算性能、网络速度、流量等压力陡增，工作效率明显降低。现代生物科学研究对大规模科学计算有很深的依赖性，平台性能对于科研进度及质量影响很大。而医学信息检测技术重点实验室正在使用的服务器是多年前部署的老机型，已经不能适应现代生物信息研究对庞杂数据处理能力的需要，尤其是运算性能、网络速度的降低，已经成为实验室提高科研能力的巨大瓶颈。

医学信息检测技术重点实验室向来被视为南方医科大学乃至整个华南地区重要的生物科学研究资源，在其发展过程中得到学校领导的高度关注。在了解到这一情况后，学校马上成立专门部门，研究实验室IT基础设施优化的解决方案。经过近2个月的严密考察与周详论证，南方医科大学最终决定采购浪潮天梭TS10000高性能服务器，解决该实验室IT系统优化问题。

这是广东省首次采用四核计算处理平台构建的TS10000高性能科学计算系统并得到成功应用。

此后，浪潮与南方医科大信息检测技术重点实验室通力配合，准确分析并把握了实验室网络应用现状和需求特点，专门设计了高性能、低成本的服务器平台浪潮天梭TS10000。它通过高性能服务器集群的并行算法，对获取的生物信息进行分配、分析、存储、解释，以满足基因比对排列运算、基因语言与调控、功能基因组学等自行开发的应用需要。

浪潮服务器的负责人介绍，浪潮天梭TS10000在医学信息检测技术重点实验室的部署，兼有计算密集型和通讯密集型的特点。浪潮提供的基于Intel四核处理节点平台的天梭TS10000集群系统，采用5+1的计算/管理配备方案，处理核心总数达到了40个，通过千兆以太网络进行各节点间的并行通讯和高速交换运算，充分满足客户对高性能计算系统的需要。在具体实施中，天梭TS10000高性能集群系统性能卓越、稳定的运行各类软件，并行效率与加速比分别高达80%和1.7，对实验室工作效率的提升大大超出了用户的预期。

"浪潮天梭TS10000高性能服务器的部署，有效地解决了原有IT资源不能充分满足实验室对高性能计算要求的矛盾；同时有利于用户后期的系统扩展升级，保护用户投资。"

该负责人对科研环境的改变非常满意："这就是信息化建设的力量，08年我们的科研任务非常繁重，但是从现在的效率看，我们有信心圆满完成。"

作为中国服务器第一品牌，浪潮一直密切关注我国生物科学研究，研发可无缝贴合客户应用的高性能服务器。早在2003年，浪潮就为华中科技大学构建了大型生物信息数据中心，这是亚太地区第一套基于Infiniband技术的科学计算平台；06年底，中国四核第一单–19个节点的浪潮天梭成为中科大生命科学院的蛋白质结构解析平台。此次南方医科大学基于四核平台的天梭系统建成，不仅显露出浪潮在高性能计算领域雄厚的技术研发实力，也进一步巩固了浪潮研发适合生物信息科研领域的高性能服务器的优势地位。

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